1. Segons el gruix de la columna, es pot dividir en dos tipus: columna envasada general i columna capil·lar.
Columna cromatogràfica empaquetada: normalment, s'utilitzen tubs d'acer inoxidable amb un diàmetre interior de 4-6 mm per formar columnes en espiral, amb una longitud de columna de 2-4 metres d'ús habitual. Omplir fase estacionària líquida (cromatografia líquida gasosa) o fase estacionària sòlida (cromatografia sòlida gasosa).
Columna de cromatografia capil·lar: el tub de la columna és un tub capil·lar, que s'utilitza habitualment com a tub capil·lar de vidre o de quars elàstic amb un diàmetre interior de 0.1-0,5 mm i la longitud de la columna oscil·la entre desenes de metres a centenars de metres.
Les columnes de cromatografia capil·lar es poden dividir en columnes capil·lars obertes i columnes capil·lars plenes segons els seus mètodes d'ompliment.
2. Segons el mecanisme de separació, es pot dividir en columnes de distribució i columnes d'adsorció, amb la principal diferència en la fase fixa.
Columna de distribució: generalment, el líquid estacionari (líquid d'alt punt d'ebullició) es recobreix al portador per formar una fase estacionària líquida, i la separació es realitza mitjançant la diferència del coeficient de partició dels components. Els grups funcionals de la solució estacionària es combinen a la superfície del portador mitjançant l'enllaç químic, que s'anomena fase d'enllaç químic. Té l'avantatge de no perdre's.
Columna d'adsorció: composta carregant l'adsorbent en una columna cromatogràfica, la separació s'aconsegueix utilitzant les diferències en els coeficients d'adsorció dels components. A més dels adsorbents, les fases estacionàries sòlides també inclouen tamisos moleculars i microesferes poroses de polímers.